Биологически, архипелаг Сокотра известен подборкой местных необычных разновидностей растений. На Сокотра есть 850 зарегистрированных разновидностей растений, из которых приблизительно 230 – 260 (приблизительно 30 процентов) являются эндемиками. Есть также десять местных родов: Ankalanthus, Ballochia, Trichocalyx, Duvaliandra, Socotranthus, Haya, Lachnocapsa, Dendrosicyos, Placoda, и Nirarathamnos; и одно почти эндемичное для архипелага семейство – Dirachmaceae.

Некоторые из растений Сокотры являются последними сохранившимися представителями своих родов на планете. Известняковые плато и горы Хагьер – самые богатые на растительность, особенно на эндемичные разновидности, области острова, но, тем не менее, эндемики могут быть найдены по всему острову в каждом типе растительности. Из-за фрагментации среды обитания и деградации, подвергаются опасности несколько местных разновидностей растений.

Местная и монотипичная Dirachma socotrana считается уязвимым видом, внесенным в IUCN, в то время как Croton pachyclados сохранился только в одном месте. Dendrosicyos – единственный представитель семейства Тыквенные, который растет в форме дерева. Euphorbia abdelkuriensis растет только на Абд аль Кури. Это подвергаемое опасности исчезновения растение представляет собой необычную разновидность Молочая, известную своим колоночными стеблями, все из которых связаны одним единственным корневищем. Всего, IUCN включает 52 местных сокотранский разновидностей растений внесенных в Красную Книгу.